Interoperabilidade é a capacidade de diferentes sistemas, até mesmo de fabricantes distintos, trocarem informações e compreenderem esses dados em contexto. Já a integração normalmente se limita à troca de informações entre pontos específicos. Ou seja, a interoperabilidade garante que o sistema receptor realmente entenda e use o dado recebido, promovendo maior flexibilidade e eficiência, enquanto a integração é, muitas vezes, mais rígida e limitada.